Кондогбья начал свою карьеру в Лансе. В 2012 году он перешел в Севилью, а в 2013 в Монако. Через 2 года Кондогбья подписал контракт с Интером. Сейчас он играет в Валенсии. Кондогбья - однократный обладатель бронзовой медали Чемпионата Испании.
Клубная карьера:
2010—2012 Ланс
2012—2013 Севилья
2013—2015 Монако
2015—2017 Интернационале
2017—н. в. Валенсия