Шкртел - один из лучших футболистов за всю историю Словакии. Он начал свою карьеру в Тренчине. В 2004 году Шкртел подписал контракт с Зенитом, а в 2008 с Ливерпулем. В 2016 году он перешел в Фенербахче, где играет и по сей день. В составе Зенита Шкртел однократный обладатель золотой медали РФПЛ.
Клубная карьера:
2002—2004 Тренчин
2004—2007 Зенит (СПб)
2008—2016 Ливерпуль
2016—н. в. Фенербахче