Вильмотс начал свою карьеру в Шальке 04. В 2004 году он возглавил Сент-Трюйден, а в 2012 сборную Бельгии. Через 5 лет Марк перешел в сборную Кот-д'Ивуара. В 2003 году Вильмотс был одновременно сенатором и тренером Шальке 04.
Тренерская карьера:
2003 Шальке 04
2004—2005 Сент-Трюйден
2012—2016 Бельгия
2017 Кот-д’Ивуар